Ang pangatlong pelikula, ang Men in Black, ay isang pagpapatuloy ng sikat na komedya ng Amerika. Ang Cast ay ang parehong Tommy Lee Jones at Will Smith. Ang gawain ng direktor ay muling kinuha sa pamamagitan ng Barry Sonnenfeld, tagagawa ng ehekutibo para kay Steven Spielberg. Sa mga sinehan, nagsimula ang pelikula noong Mayo 23, 2012.
Sa oras na ito ang papel na ginagampanan ng negatibong bayani ay kinuha ni Jamain Clement, gumaganap siya kay Boris. Ito ay isang felon na nakatakas mula sa Lunar Prison. Nag-burn siya ng galit kay Agent Kay, na noong Hulyo 1969 ay nahuli ang kriminal at iniwan siyang walang kamay. Nang biglang malaman ni Kay na tumatakbo si Boris, nagpahayag siya ng labis na panghihinayang na hindi niya siya pinatay sa pag-aresto. Pagkatapos nito, nawawala lang ang ahente, at naalala lang ni Jane na mayroon siya. Ang natitirang kawani ng itim ay nag-iisip na namatay si Kay sa isang pakikipaglaban sa ilang kriminal noong 1969.
Ang tanging paliwanag para sa kaguluhan na ito ng katotohanan ay isang pagbabago sa nakaraan. Nagpasya sina Jay at Agent O na si Boris ang sangkot. Ang pagkumpirma nito ay isa pang kaganapan ng isang kosmiko scale - ang pagsalakay sa lahi ng Boris sa Earth. Sa nakaraang katotohanan, imposible ito, dahil na-install ni Kay ang isang proteksiyon na aparato sa planeta na tinatawag na "ArcNet". Ngayon, may kaugnayan sa pagkamatay ng ahente ng ilang mga dekada na ang nakakaraan, ang Earth ay walang anumang screening mula sa mga kaaway sa kalawakan.
Natuklasan ni Jay na si Boris ay ipinadala sa nakaraan ni Jeffrey Presyo, isang negosyanteng elektroniko na mayroong ilegal na oras ng shifter sa kanyang arsenal. Ang ahente ay walang pagpipilian ngunit upang bumalik sa oras upang i-save ang kanyang kasosyo. At agad siyang inaresto ng batang Kay. Sa panahon ng interogasyon, sinabi sa kanya ni Jay ang lahat, at naniniwala ang kasosyo sa hinaharap. Sama-sama nahanap nila ang Arcanian Griffin, na may ArkNet. Ngayon ang tatlo sa kanila ay nagpapatuloy sa kanilang paglalakbay at nagtakda upang maitaguyod ang proteksyon sa buwan. Ngunit sa isang rocket sila ay naaresto ng koronel. Ngayon siya ay naging tagabantay ng misteryo ni Jay.
Mula sa sandaling ito, isang mabilis na pag-unlad ng mga kaganapan ay nagaganap. Nakikipagtagpo ang mga bayani sa dalawang Boris at nangyayari ang isang laban. Ang isang kriminal mula sa hinaharap ay itinapon sa isang minahan ng rocket, at sinusundan din siya ng batang si Boris. Naka-install ang proteksyon sa mundo. At mukhang natapos na ang misyon ni Jay, ngunit mahimalang lumilitaw ang isang batang kriminal na nakaligtas. Namatay ang koronel, ngunit namamahala si Boris na masira. At sa pelikula may isang bagong character na lilitaw. Ang isang batang lalaki ay lumabas sa kotse ng koronel at nagsisimulang maghanap ng kanyang ama. Kinikilala ng ahente ang kanyang sarili. Bumalik si Jay sa takdang oras at nakilala niya si Kay sa cafe. Bumalik na ang lahat.
